乔明琦教授多年来一直致力于肝藏象与情志致病研究领域，其中经前期综合征（PMS）病证结合研究达到国际前沿；首次提出肝气逆、肝气郁两证新证候概念，建立两证诊断标准和大鼠、猕猴模型；开发国内首类治疗经前期综合征新药--经前平颗粒、经前舒颗粒并获得新药证书。首次提出“多情交织共同致病首先伤肝”、“肝主疏泄与机体单胺类神经递质、性激素及其调节激素水平变化有关”的科学假说，并已引入中医基础理论七版教材和七年制教材。