交通与物流工程系先后开办交通监理、交通运输管理、高速公路管理、交通安全与监控、物流管理、地理信息系统、交通工程、物流工程安全工程等9个本、专科专业，培养学生4000多名，主要工作在交通工程管理、交通运输管理、物流管理、地理信息工程、城市公共交通、交通设施建设、公路工程规划等行业和部门。

　　该系经过专业整合后，现设有交通工程、物流工程、安全工程3个本科专业，并在物流工程专业下开设国际航运管理专业方向和物流管理1个专科专业。其中，物流工程被评为山东省特色专业，交通工程专业被评为山东交通学院品牌专业。

　　该系现有教师47人，其中教授6人，副教授12人，其中博士（含博士研究生）12人、硕士31人，硕士生导师9人。交通与物流工程系还从政府主管部门、大中型企业和国内外大专院校聘请兼职和客座教授10余人，定期举办专题教学和学术讲座。系还与日本国神户商船大学、加拿大马尼托巴大学等国外院校建立了校际友好合作关系，定期互派教师交流和讲学。近几年，在交通规划、交通运输管理、交通安全技术、交通事故分析与再现、交通信息一体化研究、物流规划与管理、GIS应用、城市公共交通规划等方面取得了丰硕的科研和教学成果。主持了20多项省部级科研项目和交通行业重点项目，多项获省部级奖励；主编教材与科技书籍20多部；撰写专业学术论文200余篇，其中EI、SCI、ISTP收录30余篇。

　　该系下设智能交通研究所、交通安全研究所、物流工程研究所和交通事故司法鉴定所4个科技服务机构，为学生提供良好的专业锻炼平台。系组织学生积极参加国家级、省级大学生科技竞赛活动，取得优异成绩，并在2009年获得全国物流设计大赛三等奖。

　　该系始终坚持“产学研”相结合的教学思路，注重专业实践教学环节，与多家大中型企业建立长期合作关系。在校内建有交通与物流工程实验中心，是学校重点发展实验中心之一，并被中国物流学会吸纳为产学研合作基地。该中心下设交通工程实验室、物流工程实验室、交通安全实验室。各实验室的教学设备充实，能够满足专业教学要求，实验中心的设备资产已达2000万元，为培养专业人才提供良好的实验环境。